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Jul 11, 2023

Bruker, 변형 감도, 300Hz PASEF MS/MS 및 강화된 직경을 위한 VistaScan™을 갖춘 timsTOF 초질량분석기 출시

게시일: 2023년 6월 5일 timsTOF Ultra Further Advances

게시일: 2023년 6월 5일

timsTOF Ultra는 정량적 공간 및 단일 세포 4D-단백질체학 및 4D-Lipidomics™, 면역펩티도믹스, PTM 및 단백질-단백질 상호 작용 분석을 속도와 견고성으로 더욱 발전시킵니다.

휴스턴--(Business Wire / 뉴스와이어)-- 제71회 ASMS 회의에서 Bruker Corporation(Nasdaq: BRKR)은 새로운 timsTOF Ultra 질량 분석기 출시와 함께 4D-Proteomics timsTOF 플랫폼의 혁신적인 감도를 발표했습니다. 이 제품에는 더 큰 모세관과 최적화된 와류 가스 흐름을 갖춘 새로운 CSI(캡티브 스프레이 이온화) Ultra 이온 소스, 새로운 4세대 TIMS(포획 이온 이동성 분리) XR 셀 및 14비트 디지타이저가 통합되어 있습니다. timsTOF Ultra는 1% FDR에서 0.125ng 단백질 로딩의 단일 세포 수준에서 5000개 이상의 단백질 그룹으로 매핑되는 55,000개 이상의 펩타이드를 식별할 수 있으며 <20%의 CV에서 정량화된 4,800개 이상의 단백질 그룹을 식별할 수 있습니다. 1ng 단백질 부하 수준 미만의 이러한 획기적인 감도 및 정량 성능은 새로운 벤치마크를 설정합니다. timsTOF 플랫폼의 입증된 견고성과 MS/MS에 대한 최대 300Hz의 PASEF 듀티 사이클을 갖춘 탁월한 감도는 편견 없는 단일 세포 단백질체학 및 단일 세포 지질체학을 포함하여 초미량 시료량에 대해 상당한 추가 성능 개선을 제공합니다. , 편견 없는 공간 단백질체학, 면역펩티도믹스, 인단백질체학, PTM 분석 및 단백질-단백질 상호작용(PPI) 연구.

이 보도 자료에는 멀티미디어 기능이 포함되어 있습니다. 전체 릴리스 보기: https://www.businesswire.com/news/home/20230605005326/en/

timsTOF 초질량분석기

독일 베를린 막스 델브루크 센터(Max Delbruck Center)의 공간 단백질체학(Spatial Proteomics) 그룹 리더인 파비안 코스시아(Fabian Coscia) 박사는 "timsTOF Ultra의 단일 세포 감도 dia-PASEF 워크플로우는 우리의 저입력 조직 단백질체학 연구를 새로운 수준으로 끌어올렸습니다."라고 말했습니다. Bruker의 최적화된 dia-PASEF(3x8 창) 방법과 결합된 20분 나노플로우 LC 그라데이션을 사용하여 이제 레이저로 미세 절개된 마우스 간 FFPE 조직(약 1,500μm2에 해당)에서 1,500~2,000개의 단백질을 재현성 있게 정량화할 수 있습니다. 간세포 2개."

이러한 timsTOF Ultra의 발전은 하루에 50개 샘플(SPD) 또는 최대 398 SPD와 같이 처리량이 많은 단백질체학에 대한 탁월한 견고성을 저하시키지 않고 <1% 펩타이드 및 <1%의 가장 높은 식별 신뢰도를 유지하면서 달성되었습니다. 단백질 FDR(잘못된 발견률)을 사용하여 표적 면역 인식 방법에서 볼 수 있는 교차 반응을 피합니다.

분자병리학 연구소(IMP), 그레고르 멘델 연구소(GMI), 오스트리아 과학원(IMBA) 분자 생명공학 연구소의 혁신 허브의 단백질체학 책임자인 칼 메흐틀러(Karl Mechtler) 교수는 다음과 같이 덧붙였습니다. 세포 메커니즘과 질병을 진정으로 이해하려면 다양한 세포 유형을 구별하는 것이 중요합니다. 단일 세포 분석이 판도를 바꾸고 있지만 처리량 및 분석할 수 있는 단백질 그룹의 잠재력을 극대화하는 데 장애물이 있습니다. 이는 생물학적 의미가 있습니다. 단일 세포 실험에서 6000개 이상의 단백질을 검출할 수 있습니다. timsTOF Ultra는 이러한 장벽을 극복하여 개별 세포의 프로테옴을 속도와 비교할 수 없는 감도로 탐색할 수 있습니다. timsTOF Ultra 덕분에 단일 세포 분석은 새로운 차원에 도달했습니다. , 그리고 이 획기적인 발전이 우리를 다음 어디로 이끌지 기대됩니다."

Bruker는 또한 TIMS 램프를 사중극자 스캔과 동기화하여 규모에 맞는 이온 이동성 정보를 더욱 활용할 수 있는 VistaScan 소프트웨어를 출시했습니다. 이 정교한 동적 연결 램프는 Stefan Tenzer(doi.org/10.1101/2023.01.30.526204)가 도입한 새로운 midia-PASEF 모드를 지원합니다.

요하네스 구텐베르크 대학교 마인츠(Johannes Gutenberg University Mainz)의 정량적 단백질체학 교수이자 MS 핵심 시설 책임자인 Stefan Tenzer 박사는 다음과 같이 말했습니다. "우리 연구실은 가장 높은 민감도와 가장 높은 정보 추출이 필요한 정량적 단백질체학 방법에 중점을 두고 있습니다. 우리는 Bruker와 함께 새로운 소설을 개발했습니다. 최대 정보 dia(midia) 데이터 독립 수집(dia)의 감도를 제공하는 동시에 데이터를 데이터 의존 수집(dda) 유사 스펙트럼으로 변환하는 PASEF 스캐닝 수집 모드 면역펩티도믹스 및 인산염단백질체학에 대한 midia-PASEF 잠재력은 특히 흥미롭습니다. "