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Jan 28, 2024

Bruker, 혁신적인 감도를 갖춘 timsTOF Ultra 질량 분석기 출시

헤더 홀 | 2023년 6월 8일 제71차 ASMS 회의에서 Bruker Corporation

헤더 홀 | 2023년 6월 8일

제71회 ASMS 회의에서 Bruker Corporation은 새로운 제품 출시와 함께 4D-Proteomics timsTOF 플랫폼에 대한 혁신적인 감도를 발표했습니다.timsTOF 초질량분석기 . 이 제품에는 더 큰 모세관과 최적화된 와류 가스 흐름을 갖춘 새로운 CSI(CaptiveSpray Ionization) Ultra 이온 소스, 새로운 4세대 TIMS(trapped Ion Mobility Separation) XR 셀 및 14비트 디지타이저가 통합되어 있습니다. 그만큼팀스TOF 울트라 1% FDR에서 0.125ng 단백질 로딩의 단일 세포 수준에서 5000개 이상의 단백질 그룹으로 매핑되는 55,000개 이상의 펩타이드를 식별할 수 있으며 <20%의 CV에서 정량화된 4,800개 이상의 단백질 그룹을 식별할 수 있습니다. 1ng 단백질 부하 수준 미만의 이러한 획기적인 감도 및 정량 성능은 새로운 벤치마크를 설정합니다. timsTOF 플랫폼의 입증된 견고성과 MS/MS에 대한 최대 300Hz의 PASEF 듀티 사이클을 갖춘 탁월한 감도는 편견 없는 단일 세포 단백질체학 및 단일 세포 지질체학을 포함하여 초미량 시료량에 대해 상당한 추가 성능 개선을 제공합니다. , 편견 없는 공간 단백질체학, 면역펩티도믹스, 인단백질체학, PTM 분석 및 단백질-단백질 상호작용(PPI) 연구.

"timsTOF Ultra의 단일 세포 감도 dia-PASEF 워크플로우는 우리의 저입력 조직 단백질체학 연구를 새로운 수준으로 끌어올렸습니다. Bruker의 최적화된 dia-PASEF(3×8 창) 방법과 결합된 20분 나노플로우 LC 그라데이션을 사용합니다. 이제 레이저로 미세 절개된 마우스 간 FFPE 조직(약 1~2개의 간세포에 해당하는 영역)인 1,500μm2의 FFPE 조직에서 1,500~2,000개의 단백질을 재현성 있게 정량화할 수 있습니다."라고 Max Delbruck Center의 Spatial Proteomics 그룹 리더인 Fabian Coscia 박사는 말했습니다. , 베를린.

이러한 timsTOF Ultra의 발전은 예를 들어 일일 50개 샘플(SPD) 또는 최대 398 SPD에서 높은 처리량의 단백질체학에 대한 탁월한 견고성을 저하시키지 않고 <1% 펩타이드 및 <1%의 가장 높은 식별 신뢰도를 유지하면서 달성되었습니다. % 단백질 FDR(잘못된 발견률), 표적 면역 인식 방법에서 볼 수 있는 교차 반응을 방지합니다.

"세포 메커니즘과 질병을 진정으로 이해하려면 다양한 세포 유형을 구별하는 것이 중요합니다. 단일 세포 분석이 판도를 바꾸고 있지만 처리량 및 분석할 수 있는 단백질 그룹의 잠재력을 극대화하는 데 장애물이 있습니다. 단일 세포 실험에서 6000개 이상의 단백질을 검출하는 생물학적 감각 timsTOF Ultra는 이러한 장벽을 극복하여 개별 세포의 프로테옴을 속도와 비교할 수 없는 감도로 탐색할 수 있습니다. timsTOF Ultra 덕분에 단일 세포 분석에 도달했습니다. 저는 이 획기적인 발전이 우리를 다음 어디로 이끌지 기대하고 있습니다."라고 Gregor Mendel Institute(GMI)의 분자 병리학 연구소(IMP) 혁신 허브의 단백질체학 책임자인 Karl Mechtler 교수는 말했습니다. 오스트리아 과학 아카데미(IMBA)의 분자 생명공학 연구소.

Bruker도 소개합니다.비스타스캔 TIMS 램프를 사중극자 스캔과 동기화하여 규모에 맞는 이온 이동성 정보를 더욱 활용할 수 있는 소프트웨어입니다. 이 정교한 동적 연결 램프는 새로운 기능을 지원합니다.미디어-PASEFStefan Tenzer가 소개한 모드입니다.

"우리 연구실은 가장 높은 감도와 가장 높은 정보 추출이 필요한 정량적 단백질체학 방법에 중점을 두고 있습니다. Bruker와 함께 데이터 독립적 수집(dia)의 감도를 제공하는 새로운 최대 정보 dia(midia) PASEF 스캐닝 수집 모드를 개발했습니다. 마인츠 요하네스 구텐베르크 대학의 정량 단백질체학 교수이자 MS 핵심 시설 책임자인 스테판 텐저(Stefan Tenzer) 박사는 "데이터를 데이터 의존적 획득(dda) 유사 스펙트럼으로 변환하면서 면역펩티도믹스와 인단백질체학에 대한 midia-PASEF의 잠재력은 특히 흥미롭다"고 말했습니다. .

Bruker는 독점 라이센스를 보유하고 있습니다.미디어-PASEF요하네스 구텐베르크 대학교 마인츠(Johannes Gutenberg University Mainz) 출신이며 곧 출시할 예정입니다.